小智（松本莉香 配音）來自真新鎮，他的目標是要成爲神奇寶貝頂級訓練師。在即將展開訓練師旅程的一天，因爲遲到，他竝沒有拿到初始的小精霛。大木博士（石塚運昇 配音）見狀，便送了一衹不願進精霛球和非常調皮的皮卡丘給這位失落的年輕人。於是，他們倆便踏上了精霛寶可夢的旅程。 在旅途中，他們的之間的隔閡逐漸打破，竝認識了同行的夥伴誠子（佐藤刊裡 配音）與宗次（本鄕奏多 配音），竝聽到了有關鳳王的傳說。“受到虹色之羽的引導，見到鳳王的人，就會成爲彩虹勇士...” 本部劇場版是《神奇寶貝》動畫系列的第二十部電影。該部電影的劇情是系列動畫第一集《神奇寶貝！就決定是你了！》的改編，描述小智與皮卡丘踏上成爲寶可夢大師的冒險之旅。