「候鳥e人」的故事主軸，圍繞著一群關心候鳥生態的年輕人，描寫一段從潟湖溼地展開的浪漫愛情，「候鳥e人」的情節就像不同季節候鳥的飛翔路逕，從七股到關渡，從馬祖無人小島來到時尚現代的台北街頭。小青、邵韓和湘子，三個頻率接近，彼此互爲同伴。卻不得不在講求唯一的愛情裡，麪對著得到與市區的角色。鳥人和黑琵在網路裡相遇，也在現實生活裡交會。邵韓和小青在到七股賞鳥的途中，兩人因擦撞而結識。彼此劍拔弩張，邵韓的好友小汪同時也愛上了小青。等到兩人終於在現實世界中相識，愛情與友情的取捨，該如何是好！而邵韓以爲死去的初戀女友湘子，其實還在人世，過往的真情、愧疚與責任，新歡與舊愛之間的掙紥，更令他手足無措。至情至性的他，該如何抉擇？媮媮愛著小汪的丁丁，癡癡守候著丁丁的小謝，又會發展出怎樣的情節？